Die Blue Lagoon liegt 200 Meter von der Hafeneinfahrt von Padangbai entfernt. Ihre sichelförmige Bucht ist durch vulkanische Landzungen geschützt, die die Strömungen der Lombokstraße zu einer nahezu lagunenartigen Klarheit beruhigen.
Das Riffsystem bildete sich hier über Jahrtausende, als kalte Auftriebswasser aus der tiefen Badung-Straße auf warme Oberflächenströmungen trafen, wodurch nährstoffreiche Bedingungen entstanden, die über 300 Korallenarten und schätzungsweise 500 Fischarten beherbergen. Lokale Naturschutzgruppen unterhalten seit 2018 künstliche Riffstrukturen, um die Regeneration der Korallen in den durch das Bleichereignis von 2016 geschädigten Gebieten zu beschleunigen.
Padangbais Rolle als Fährhafen nach Lombok und zu den Gili-Inseln hat paradoxerweise die Meeresökologie der Blue Lagoon bewahrt. Kommerzielle Fischereifahrzeuge meiden die flache Bucht, und die Wirtschaft des Dorfes verlagerte sich Anfang der 2000er Jahre auf einen sanften Tauchtourismus. Heute wird die Stätte im Rahmen eines von der Gemeinde verwalteten Meeresschutzgebietes betrieben, wobei Tauchanbieter regelmäßige Riffuntersuchungen und die Entfernung von Abfällen finanzieren. Die Sichtweite beträgt je nach Saison durchschnittlich 12 bis 18 Meter, wobei das Wasser von April bis Oktober am klarsten ist, wenn Südost-Passatwinde das Oberflächenplankton ablandig treiben.
Die Riffstruktur unterteilt sich in drei Zonen. Das flache Ufergebiet, zwei bis vier Meter tief, beherbergt Geweih- und Tischkorallen, die als Kinderstube für junge Papageienfische, Riffbarsche und Lippfische dienen. Der mittlere Riffhang, vier bis acht Meter tief, bietet Hirnkorallen und Seefächer, durchsetzt mit sandigen Kanälen, in denen sich blaupunktierte Stechrochen ausruhen. Der äußere Riffkante fällt steil auf 15 Meter ab und zieht pelagische Besucher an, darunter Stachelmakrelenschwärme, gelegentliche Riffhaie und saisonale Mantarochen während der Planktonblüte von September bis November. Schnorchler erkunden normalerweise die küstennahen Zonen und den mittleren Riffhang, wo die Korallendichte und Fischaktivität zwischen Morgengrauen und Vormittag am höchsten ist, bevor der tägliche Ostwind auffrischt.
Die Nähe der Blue Lagoon zum Dorf Padangbai — ein fünfminütiger Fußweg vom Hauptfährterminal — hat sie zum zugänglichsten Rifftauchplatz in Ost-Bali gemacht. Das Fehlen einer Eintrittsgebühr spiegelt das kooperative Managementmodell des Dorfes wider, das den Zugang der Gemeinde gegenüber der Gewinnmaximierung durch Tourismus priorisiert. Kleine Warungs säumen den Strand, und der angrenzende Bias Tugel Strand bietet einen zweiten Schnorchelplatz mit weicherem Sand und weniger Strömung, ideal für Schnorchel-Anfänger oder diejenigen, die ruhigere Bedingungen suchen.
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